תוכנית אמירים למצוינות מתמקדת בחשיפת תכנים ייחודיים שאינם בתוכנית הלימודים הרגילה, וכן ברכישת מיומנויות חקר וחשיבה.
מטרת התוכנית - העמקת הידע בתחומי המדע, הספרות והמיומניות האישיות (העצמה מנהיגותית)
קהל היעד - תלמידי כיתות ט' מצוינים שהומלצו על ידי הצוות הפדגוגי + ראיון אישי
דרישות - תלמידים בעלי הישגים גבוהיים, המגלים עניין ומוטבציה בעולמות תוכן נוספים.
תקופת הלימודים -השעות משולבות במערכת השעות הבית ספרית ונמשכות לאורך השנה
מיקום הפעילות - במתחם בית הספר - על יסודי משגב